1、数据规范性、安全性
传统的纸制单证易损毁、难保存。现在所有数据均电子化，电子数据以其安全、便捷、易查询、便于统计和计算的突出优点，让日常业务的开展更为方便。即使是老员工离职，也不会出现新员工难以接替的问题。
2、提供电子化手册的掌控渠道
加工贸易企业使用电子化手册以后，取消了原有纸质手册的使用，实现简便快捷操作的同时却缺少了对日常进出口情况记录的实物载体，对手册备案详细信息、当前进出口情况得不到及时的了解。 企业在异地报关时，异地的报关公司一般会要求企业提供手册的备案信息，以便于报关操作时进行核对。这样就需要企业通过办理手册的代理公司导出手册的备案信息。而保税加工辅助核销系统中详细记录了加工贸易企业的手册备案信息及日常报关数据，为企业提供灵活的电子化手册掌控渠道。
3、手册余量自动提醒
系统会根据企业手册的备案信息和日常的报关情况，及时计算手册的余量，方便企业提前做好增补准备，防止出现料件超进、成品超出情况的发生，保证加工贸易货物的正常进出口。
4、倒挂提醒 系统帮助企业提供一系列的预警提醒功能，如时间倒挂、金额倒挂、重量倒挂、退单提醒等。便于企业随时了解手册情况，在报核前提前查找原因并解决问题。 
5、核销报表自动生成将核销工作放到日常工作中来做，方便企业对保税料件实际动态的掌控。在日常工作中维护基础数据，将日常工作形成记录，企业不用依赖Excel或资讯人员，各类复杂运算由系统完成，随时生成进出口情况汇总、出口耗用合计、核销平衡表及电子化手册正式报核所需的基本信息、报关单、料件表、成品表、单损耗表数据，企业无需整理两套核销资料，将系统生成的正式报核信息提供给报关公司进行正式报核，起到数据一次维护多次使用的作用，方便企业对保税料件实际动态的掌控。  | 
